Das Netz der Fundamente der trajanischen Lagerhäuser zeigt sich als eine solide und einheitliche Plattform, die mehr als einen Meter über dem antiken Meeresspiegel liegt. Die extrem breiten und tiefen Fundamente - zunächst in opus caementicium in Holzschalung bis zum Bodenniveau errichtet, dann mit einer Tuffsteinverkleidung in opus reticulatum erhöht - weisen die typischen Konstruktionsmerkmale von Anlagen aus der claudischen Zeit auf. Die Solidität dieses Fundamentnetzes erklärt, warum das Baudenkmal seinen ursprünglichen Grundriss über die Jahrhunderte hinweg immer beibehalten hat.