Der Fürst Giovanni Torlonia hatte ab den 1920er Jahren großen Einfluss auf die Gestaltung der Vegetation des Gebiets. Neben der Anpflanzung der meisten der heute vorhandenen Kiefern wurden in den folgenden Jahren zahlreiche Obstbäume gepflanzt, vor allem auf dem Gelände rund um das Landhaus, die heute nicht mehr vorhanden sind. Die einzigen ästhetischen und geometrischen Linien, die heute noch erkennbar sind, sind die der Reihe von Platanus hybrida, die zum Kaiserpalast führt, die Cupressus sempervirens im Bereich des Landhauses und die von Pinuspinea und Quercusilex, die entlang des Kais der trajanischen Lagerhäuser und rund um das Hafenbecken wachsen. Die jüngste Bepflanzung ist die Reihe von Eucalyptus globulus entlang des Zauns am Eingang zum archäologischen Gebiet. Spontane Vegetation findet sich vor allem entlang der Abflüsse des Lago di Traiano und im Hafenbecken: Hier wechseln sich Sumpfpflanzen, die auch Nistplätze für Zugvögel sind, mit Lorbeer, Schneeball und Stechpalmen-Kreuzdorn ab.
Sumpfvegetation innerhalb des Hafenbeckens
. Eiche
Eine Kiefer über den archäologischen Strukturen
Zypresse vor dem Belvedere der severischen Lagerhäuser
Eine Reihe von Eukalyptusbäumen