Le réseau de fondations des Magazzini Traianei (Entrepôts de Trajan) se présente comme une plateforme solide et uniforme, surélevée de plus d'un mètre par rapport à l'ancien niveau de la mer. Extrêmement larges et profondes, les fondations - d'abord construites en opus caementicium dans des coffrages en bois jusqu'au niveau du plancher, puis rehaussées d'un parement de tuf réticulé - présentent les caractéristiques de construction typiques des chantiers d'époque claudienne. La solidité de ce réseau de fondations explique que ce monument ait conservé son plan d'origine à travers les siècles.