In het gebied tussen de kade en de portico van Claudius stonden in ieder geval vanaf de 2e eeuw n.Chr. gebouwen die voornamelijk dienden als pakhuis. In het westelijke deel van de muren (de zogenaamde Antemurale) zijn de overblijfselen bewaard gebleven van ten minste twee, tussen de tweede helft van de 4e en de tweede helft van de 5e eeuw n.Chr. herbouwde pakhuizen die getuigen van de fundamentele rol die Portus ook in deze periode nog vertolkte. Ze verrezen op korte afstand van een belangrijk openbaar gebouw, de Porticus Placidiana, uit 425 n.Chr., op de noordelijke oever van de Fossa Traiana. Hun ligging vlakbij het kanaal getuigt van de geleidelijke verschuiving - in de vroege middeleeuwen - van de havenactiviteiten naar de Fossa Traiana.
Luchtfoto van een van de laatantieke pakhuizen die in de muren zijn opgenomen
Reconstructie van de begane grond van een van de pakhuizen
(M. Serlorenzi)
Plattegrond van het zuidelijke deel van de muren en pakhuizen
Pakhuizen van de Antemurale tijdens de opgravingen