De twee belangrijkste bouwfasen na het tijdperk van Claudius zijn die van de Antonijnse en Severische periode. Er zijn echter ook interventies uit de late oudheid gevonden, waarvan vooral de bouw van de ommuring, aan het einde van de 5e eeuw n.Chr. van groot belang is. Tijdens de Antonijnse periode werd een nieuwe verdieping gebouwd boven de cellae langs de portico van Claudius en werd het laden en lossen van de bovenste cellae van de drie dwarscomplexen geperfectioneerd met nieuwe hellingbanen. In de Severische periode werden daarentegen de meeste cellae van de drie gebouwen gerestaureerd en werden de opslagruimten verder uitgebreid om te voldoen aan de voortdurend groeiende behoeften van de hoofdstad.
Afsluiting van de noordzijde van de Magazzini Traianei, met Severische pilaren en laatantieke muren
(foto École française de Rome)
Reconstructie van de doorsnedetekening van de oost-west lopende gebouwen: hellingbanen en hijswerktuigen
(foto École française de Rome)
De tijdens de renovaties van de Severische periode ingebouwde zuilengalerij van de portico van Claudius