Начиная с 1920-х годов, на развитие флоры данной местности значительное влияние оказала деятельность принца Джованни Торлония. Помимо посадки большинства произрастающих здесь сегодня сосен, на протяжении последующих лет были посажены многочисленные фруктовые деревья, в частности на участке вокруг Казале, затем вырубленные. Единственное, что нам напоминает об эстетической и геометрической планировке того времени - это аллея платанов Platanus ibrida, ведущая к Императорскому дворцу, кипарисов Cupressus sempervirens вокруг Казале, сосен Pinus pinea и дубов Quercus ilex, растущих вдоль набережной Траянских складов и дока. Позднее всего были посажены эвкалипты Eucalyptus globulus вдоль ограды у входа в археологический парк. Дикорастущие растения в основном произрастают вдоль спускных каналов озера Траяна и в доке: здесь можно найти болотные растения, которые являются местом гнездования перелетных птиц, а также лавр, калину и крушину.
Болотные растения на территории дока
Дуб
Сосна, произрастающая на археологических сооружениях
Кипарисовое дерево перед бельведером Северианских складов
Эвкалипты